Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccl20O89093 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccl20O89093 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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