Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stx8O88983 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stx8O88983 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx8O88983 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stx8O88983 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stx8O88983 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stx8O88983 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx8O88983 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx8O88983 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx8O88983 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx8O88983 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stx8O88983 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx8O88983 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx8O88983 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms