Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrrc6O88978 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc6O88978 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms