Protein–RNA interactions for Protein: O88809

Dcx, Neuronal migration protein doublecortin, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcxO88809 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DcxO88809 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DcxO88809 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DcxO88809 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DcxO88809 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DcxO88809 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DcxO88809 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DcxO88809 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DcxO88809 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DcxO88809 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DcxO88809 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DcxO88809 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DcxO88809 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DcxO88809 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DcxO88809 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DcxO88809 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DcxO88809 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DcxO88809 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DcxO88809 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DcxO88809 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DcxO88809 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DcxO88809 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DcxO88809 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DcxO88809 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DcxO88809 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DcxO88809 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DcxO88809 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DcxO88809 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DcxO88809 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DcxO88809 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DcxO88809 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DcxO88809 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DcxO88809 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DcxO88809 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DcxO88809 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DcxO88809 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DcxO88809 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DcxO88809 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DcxO88809 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DcxO88809 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DcxO88809 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DcxO88809 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DcxO88809 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DcxO88809 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DcxO88809 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DcxO88809 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DcxO88809 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DcxO88809 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DcxO88809 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DcxO88809 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DcxO88809 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DcxO88809 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DcxO88809 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DcxO88809 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DcxO88809 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DcxO88809 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DcxO88809 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DcxO88809 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DcxO88809 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DcxO88809 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DcxO88809 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DcxO88809 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DcxO88809 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DcxO88809 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DcxO88809 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DcxO88809 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DcxO88809 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DcxO88809 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DcxO88809 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DcxO88809 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DcxO88809 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DcxO88809 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DcxO88809 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DcxO88809 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DcxO88809 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DcxO88809 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DcxO88809 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DcxO88809 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DcxO88809 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DcxO88809 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DcxO88809 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DcxO88809 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DcxO88809 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DcxO88809 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DcxO88809 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DcxO88809 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DcxO88809 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DcxO88809 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DcxO88809 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DcxO88809 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DcxO88809 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DcxO88809 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DcxO88809 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DcxO88809 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DcxO88809 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DcxO88809 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DcxO88809 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DcxO88809 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DcxO88809 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DcxO88809 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.3 ms