Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc1O88447 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc1O88447 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klc1O88447 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klc1O88447 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klc1O88447 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klc1O88447 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klc1O88447 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klc1O88447 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klc1O88447 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klc1O88447 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klc1O88447 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Klc1O88447 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms