Protein–RNA interactions for Protein: O88282

Bcl6b, B-cell CLL/lymphoma 6 member B protein, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl6bO88282 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bcl6bO88282 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bcl6bO88282 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bcl6bO88282 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bcl6bO88282 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bcl6bO88282 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bcl6bO88282 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bcl6bO88282 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bcl6bO88282 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bcl6bO88282 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bcl6bO88282 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bcl6bO88282 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bcl6bO88282 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bcl6bO88282 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bcl6bO88282 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bcl6bO88282 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bcl6bO88282 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bcl6bO88282 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bcl6bO88282 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms