Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xirp1O70373 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Xirp1O70373 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms