Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hmx1O70218 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmx1O70218 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms