Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AurkbO70126 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AurkbO70126 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AurkbO70126 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AurkbO70126 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AurkbO70126 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AurkbO70126 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AurkbO70126 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AurkbO70126 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms