Protein–RNA interactions for Protein: O55186

Cd59a, CD59A glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd59aO55186 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd59aO55186 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd59aO55186 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd59aO55186 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd59aO55186 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd59aO55186 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd59aO55186 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd59aO55186 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd59aO55186 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd59aO55186 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd59aO55186 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd59aO55186 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd59aO55186 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd59aO55186 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd59aO55186 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd59aO55186 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms