Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cyp26a1O55127 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp26a1O55127 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp26a1O55127 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp26a1O55127 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp26a1O55127 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp26a1O55127 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp26a1O55127 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp26a1O55127 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp26a1O55127 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp26a1O55127 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp26a1O55127 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp26a1O55127 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp26a1O55127 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp26a1O55127 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms