Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PrxO55103 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PrxO55103 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PrxO55103 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PrxO55103 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PrxO55103 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PrxO55103 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PrxO55103 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PrxO55103 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PrxO55103 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PrxO55103 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PrxO55103 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PrxO55103 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PrxO55103 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PrxO55103 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PrxO55103 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
PrxO55103 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PrxO55103 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PrxO55103 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PrxO55103 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PrxO55103 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PrxO55103 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PrxO55103 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PrxO55103 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PrxO55103 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PrxO55103 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PrxO55103 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PrxO55103 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PrxO55103 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PrxO55103 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PrxO55103 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PrxO55103 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PrxO55103 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PrxO55103 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PrxO55103 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PrxO55103 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PrxO55103 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PrxO55103 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PrxO55103 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PrxO55103 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PrxO55103 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PrxO55103 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PrxO55103 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PrxO55103 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PrxO55103 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PrxO55103 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PrxO55103 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PrxO55103 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PrxO55103 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PrxO55103 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PrxO55103 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PrxO55103 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PrxO55103 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PrxO55103 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PrxO55103 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PrxO55103 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PrxO55103 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PrxO55103 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PrxO55103 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PrxO55103 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PrxO55103 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PrxO55103 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PrxO55103 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PrxO55103 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PrxO55103 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PrxO55103 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PrxO55103 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PrxO55103 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PrxO55103 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PrxO55103 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PrxO55103 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PrxO55103 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PrxO55103 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PrxO55103 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PrxO55103 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PrxO55103 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PrxO55103 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PrxO55103 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PrxO55103 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PrxO55103 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
PrxO55103 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PrxO55103 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PrxO55103 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PrxO55103 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PrxO55103 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PrxO55103 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PrxO55103 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PrxO55103 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PrxO55103 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PrxO55103 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PrxO55103 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PrxO55103 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PrxO55103 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PrxO55103 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PrxO55103 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PrxO55103 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PrxO55103 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PrxO55103 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PrxO55103 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PrxO55103 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms