Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Syngr2O55101 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms