Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NlkO54949 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NlkO54949 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NlkO54949 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NlkO54949 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NlkO54949 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NlkO54949 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NlkO54949 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NlkO54949 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NlkO54949 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NlkO54949 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NlkO54949 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NlkO54949 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NlkO54949 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NlkO54949 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NlkO54949 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NlkO54949 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NlkO54949 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NlkO54949 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NlkO54949 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NlkO54949 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NlkO54949 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NlkO54949 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NlkO54949 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NlkO54949 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NlkO54949 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NlkO54949 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NlkO54949 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NlkO54949 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NlkO54949 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NlkO54949 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NlkO54949 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NlkO54949 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NlkO54949 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NlkO54949 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NlkO54949 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NlkO54949 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NlkO54949 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NlkO54949 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NlkO54949 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NlkO54949 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NlkO54949 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NlkO54949 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NlkO54949 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NlkO54949 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NlkO54949 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NlkO54949 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NlkO54949 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NlkO54949 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NlkO54949 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NlkO54949 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NlkO54949 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NlkO54949 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NlkO54949 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NlkO54949 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NlkO54949 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NlkO54949 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NlkO54949 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NlkO54949 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NlkO54949 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NlkO54949 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NlkO54949 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NlkO54949 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NlkO54949 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NlkO54949 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NlkO54949 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NlkO54949 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NlkO54949 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NlkO54949 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NlkO54949 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NlkO54949 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NlkO54949 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NlkO54949 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NlkO54949 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NlkO54949 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NlkO54949 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NlkO54949 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NlkO54949 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NlkO54949 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NlkO54949 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NlkO54949 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NlkO54949 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NlkO54949 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NlkO54949 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NlkO54949 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NlkO54949 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NlkO54949 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NlkO54949 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NlkO54949 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NlkO54949 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NlkO54949 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NlkO54949 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NlkO54949 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NlkO54949 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NlkO54949 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NlkO54949 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NlkO54949 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NlkO54949 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NlkO54949 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NlkO54949 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms