Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnajb6O54946 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnajb6O54946 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajb6O54946 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajb6O54946 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajb6O54946 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajb6O54946 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnajb6O54946 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnajb6O54946 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnajb6O54946 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnajb6O54946 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms