Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr6O54689 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr6O54689 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccr6O54689 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms