Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cops5O35864 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cops5O35864 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cops5O35864 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cops5O35864 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cops5O35864 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cops5O35864 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cops5O35864 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cops5O35864 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops5O35864 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 532.7 ms