Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Cited2O35740 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited2O35740 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited2O35740 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited2O35740 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited2O35740 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cited2O35740 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cited2O35740 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cited2O35740 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cited2O35740 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cited2O35740 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cited2O35740 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cited2O35740 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cited2O35740 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cited2O35740 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cited2O35740 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cited2O35740 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cited2O35740 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cited2O35740 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cited2O35740 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cited2O35740 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cited2O35740 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cited2O35740 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cited2O35740 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cited2O35740 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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