Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf9O35739 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf9O35739 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf9O35739 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf9O35739 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf9O35739 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf9O35739 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf9O35739 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf9O35739 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf9O35739 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf9O35739 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms