Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pold2O35654 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pold2O35654 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pold2O35654 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pold2O35654 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pold2O35654 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pold2O35654 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pold2O35654 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pold2O35654 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pold2O35654 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pold2O35654 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pold2O35654 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pold2O35654 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pold2O35654 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pold2O35654 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pold2O35654 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pold2O35654 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms