Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stag2O35638 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stag2O35638 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Stag2O35638 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stag2O35638 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stag2O35638 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stag2O35638 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stag2O35638 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stag2O35638 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stag2O35638 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stag2O35638 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms