Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edil3O35474 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edil3O35474 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edil3O35474 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edil3O35474 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edil3O35474 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edil3O35474 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edil3O35474 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Edil3O35474 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edil3O35474 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edil3O35474 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edil3O35474 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Edil3O35474 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edil3O35474 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Edil3O35474 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms