Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna3O35344 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms