Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh2d1bO35324 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d1bO35324 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh2d1bO35324 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh2d1bO35324 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d1bO35324 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d1bO35324 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d1bO35324 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d1bO35324 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d1bO35324 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d1bO35324 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d1bO35324 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d1bO35324 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d1bO35324 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d1bO35324 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms