Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc18a3O35304 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc18a3O35304 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc18a3O35304 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms