Protein–RNA interactions for Protein: O35136

Ncam2, Neural cell adhesion molecule 2, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncam2O35136 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ncam2O35136 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ncam2O35136 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ncam2O35136 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ncam2O35136 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ncam2O35136 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ncam2O35136 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ncam2O35136 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ncam2O35136 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ncam2O35136 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ncam2O35136 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ncam2O35136 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ncam2O35136 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ncam2O35136 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ncam2O35136 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ncam2O35136 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ncam2O35136 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ncam2O35136 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ncam2O35136 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ncam2O35136 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ncam2O35136 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms