Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq2O09161 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq2O09161 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casq2O09161 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Casq2O09161 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Casq2O09161 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq2O09161 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq2O09161 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq2O09161 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casq2O09161 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casq2O09161 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casq2O09161 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casq2O09161 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casq2O09161 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casq2O09161 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casq2O09161 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casq2O09161 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casq2O09161 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casq2O09161 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Casq2O09161 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casq2O09161 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms