Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Dctn1O08788 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dctn1O08788 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dctn1O08788 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dctn1O08788 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms