Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MsmbO08540 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MsmbO08540 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MsmbO08540 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsmbO08540 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsmbO08540 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MsmbO08540 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsmbO08540 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MsmbO08540 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsmbO08540 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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