Protein–RNA interactions for Protein: L7N479

Tcrg-C3, T cell receptor gamma, constant 3, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-C3L7N479 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-C3L7N479 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-C3L7N479 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-C3L7N479 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-C3L7N479 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcrg-C3L7N479 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-C3L7N479 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-C3L7N479 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-C3L7N479 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-C3L7N479 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-C3L7N479 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-C3L7N479 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-C3L7N479 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-C3L7N479 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-C3L7N479 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-C3L7N479 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcrg-C3L7N479 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tcrg-C3L7N479 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-C3L7N479 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-C3L7N479 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-C3L7N479 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-C3L7N479 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-C3L7N479 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-C3L7N479 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-C3L7N479 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-C3L7N479 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-C3L7N479 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-C3L7N479 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-C3L7N479 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-C3L7N479 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-C3L7N479 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-C3L7N479 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms