Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20878L7N244 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm20878L7N244 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20878L7N244 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms