Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm2888K7N746 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2888K7N746 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2888K7N746 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2888K7N746 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2888K7N746 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2888K7N746 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2888K7N746 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2888K7N746 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2888K7N746 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm2888K7N746 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm2888K7N746 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm2888K7N746 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm2888K7N746 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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