Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc191J3QQ27 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc191J3QQ27 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms