Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm9602J3QPD5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms