Protein–RNA interactions for Protein: J3QNR8

Trim34b, Tripartite motif-containing 34B, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34bJ3QNR8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim34bJ3QNR8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim34bJ3QNR8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim34bJ3QNR8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim34bJ3QNR8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim34bJ3QNR8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trim34bJ3QNR8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trim34bJ3QNR8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim34bJ3QNR8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim34bJ3QNR8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim34bJ3QNR8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms