Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21060J3KMU4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21060J3KMU4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms