Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Pcf11G3X9Z4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Pcf11G3X9Z4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Pcf11G3X9Z4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Pcf11G3X9Z4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Pcf11G3X9Z4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Pcf11G3X9Z4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Pcf11G3X9Z4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Pcf11G3X9Z4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Pcf11G3X9Z4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Pcf11G3X9Z4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Pcf11G3X9Z4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Pcf11G3X9Z4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Pcf11G3X9Z4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Pcf11G3X9Z4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pcf11G3X9Z4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pcf11G3X9Z4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pcf11G3X9Z4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pcf11G3X9Z4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pcf11G3X9Z4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pcf11G3X9Z4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Pcf11G3X9Z4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Pcf11G3X9Z4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Pcf11G3X9Z4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Pcf11G3X9Z4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Pcf11G3X9Z4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Pcf11G3X9Z4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Pcf11G3X9Z4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Pcf11G3X9Z4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Pcf11G3X9Z4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pcf11G3X9Z4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pcf11G3X9Z4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pcf11G3X9Z4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pcf11G3X9Z4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Pcf11G3X9Z4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Pcf11G3X9Z4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pcf11G3X9Z4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms