Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna9G3X8Z7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chrna9G3X8Z7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.2 ms