Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim55G3X8Y1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim55G3X8Y1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim55G3X8Y1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim55G3X8Y1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim55G3X8Y1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim55G3X8Y1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim55G3X8Y1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim55G3X8Y1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim55G3X8Y1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim55G3X8Y1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim55G3X8Y1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim55G3X8Y1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim55G3X8Y1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim55G3X8Y1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim55G3X8Y1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim55G3X8Y1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim55G3X8Y1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms