Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U2

1700067P10Rik, RIKEN cDNA 1700067P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700067P10RikG3X8U2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700067P10RikG3X8U2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700067P10RikG3X8U2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms