Protein–RNA interactions for Protein: G3UXE9

Gm8909, Predicted gene 8909, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8909G3UXE9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8909G3UXE9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8909G3UXE9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8909G3UXE9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8909G3UXE9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8909G3UXE9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8909G3UXE9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8909G3UXE9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8909G3UXE9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8909G3UXE9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8909G3UXE9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms