Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nkx1-1G3UXB3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx1-1G3UXB3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms