Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r76F8VQ63 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms