Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LctF8VPT3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LctF8VPT3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LctF8VPT3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LctF8VPT3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms