Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10378F6XQQ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10378F6XQQ1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10378F6XQQ1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10378F6XQQ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10378F6XQQ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10378F6XQQ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10378F6XQQ1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm10378F6XQQ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm10378F6XQQ1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm10378F6XQQ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm10378F6XQQ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm10378F6XQQ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm10378F6XQQ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm10378F6XQQ1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm10378F6XQQ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm10378F6XQQ1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm10378F6XQQ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm10378F6XQQ1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm10378F6XQQ1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
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