Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sptbn5F6UCX4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sptbn5F6UCX4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sptbn5F6UCX4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms