Protein–RNA interactions for Protein: E9QAB6

Ptar1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptar1E9QAB6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptar1E9QAB6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptar1E9QAB6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptar1E9QAB6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptar1E9QAB6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptar1E9QAB6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptar1E9QAB6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptar1E9QAB6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptar1E9QAB6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptar1E9QAB6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptar1E9QAB6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptar1E9QAB6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptar1E9QAB6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptar1E9QAB6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ptar1E9QAB6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptar1E9QAB6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptar1E9QAB6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptar1E9QAB6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms