Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TrdnE9Q9K5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TrdnE9Q9K5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TrdnE9Q9K5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TrdnE9Q9K5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TrdnE9Q9K5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TrdnE9Q9K5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TrdnE9Q9K5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TrdnE9Q9K5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TrdnE9Q9K5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrdnE9Q9K5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.7 ms