Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Urb2E9Q7L1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Urb2E9Q7L1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Urb2E9Q7L1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Urb2E9Q7L1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Urb2E9Q7L1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Urb2E9Q7L1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Urb2E9Q7L1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Urb2E9Q7L1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Urb2E9Q7L1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Urb2E9Q7L1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Urb2E9Q7L1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Urb2E9Q7L1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Urb2E9Q7L1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Urb2E9Q7L1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Urb2E9Q7L1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Urb2E9Q7L1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Urb2E9Q7L1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms