Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Srsf11E9Q6E5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srsf11E9Q6E5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srsf11E9Q6E5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srsf11E9Q6E5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srsf11E9Q6E5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srsf11E9Q6E5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srsf11E9Q6E5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srsf11E9Q6E5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srsf11E9Q6E5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srsf11E9Q6E5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srsf11E9Q6E5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srsf11E9Q6E5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srsf11E9Q6E5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srsf11E9Q6E5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srsf11E9Q6E5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srsf11E9Q6E5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srsf11E9Q6E5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srsf11E9Q6E5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srsf11E9Q6E5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms